Seul les disques dur sont sensibles à la fragmentation, leur tête de lecture se déplacant sur un plateau en rotation pour lire les données.

En informatique, la défragmentation est un procédé logiciel destiné à réorganiser les données éparpillées sur un disque dur, problème que l'on nomme fragmentation.

Le simple usage d'un ordinateur pour consulter internet, installer et désinstaller des logiciels ou encore effacer des données finit par fragmenter le système de fichier présent sur le disque dur. Ce phénomène allonge progressivement le temps d'accès aux fichiers, ce qui ralentit l'ordinateur affecté.

Pour y remédier, de petits logiciels nommés défragmenteurs sont souvent inclus dans les systèmes d'exploitation. À défaut, des utilitaires gratuits, comme Diskdefrag, sont librement téléchargeables.

Très simples, ces logiciels rassemblent les fragments de fichiers éparpillés sur le disque dur de façon à permettre leur lecture en un seul passage ce qui accélère d'autant l'accès aux données comme l'ouverture des applications, les têtes de lecture n'ayant par à se déplacer physiquement à plusieurs endroits pour lire le contenu d'un même fichier.

À noter que les nouvelles formes de stockage statique telles que les SSD (Solid State Disk) n'ont pas besoin d'être défragmentées, car la position des données n'affecte pas les temps d'accès quasi instantanés de la mémoire flash.

Enfin, tous les systèmes d'exploitation ne se fragmentent pas de la même manière. Certains y sont plus sensibles que d'autres (Microsoft Windows, Google Android, notamment) en fonction du système d'allocation des fichiers utilisé. Tous les systèmes récents sont aussi capables de détecter la présence de SSD et de désactiver la défragmentation automatique qui tout en étant inutile, finirait par réduire la durée de vie de ces derniers.